Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rims1Q99NE5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms