Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms