Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcgf6Q99NA9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcgf6Q99NA9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms