Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl43Q99N89 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms