Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms