Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SrrtQ99MR6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms