Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gins4Q99LZ3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms