Protein–RNA interactions for Protein: Q99LS3

Psph, Phosphoserine phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsphQ99LS3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms