Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcbtb2Q99LJ7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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