Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cstf3Q99LI7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms