Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Sh3bp5lQ99LH9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp5lQ99LH9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp5lQ99LH9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Sh3bp5lQ99LH9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Sh3bp5lQ99LH9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Sh3bp5lQ99LH9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Sh3bp5lQ99LH9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp5lQ99LH9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp5lQ99LH9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp5lQ99LH9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp5lQ99LH9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp5lQ99LH9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp5lQ99LH9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp5lQ99LH9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp5lQ99LH9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp5lQ99LH9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp5lQ99LH9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp5lQ99LH9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp5lQ99LH9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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