Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp16Q99LG0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms