Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q99KU6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q99KU6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q99KU6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q99KU6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q99KU6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q99KU6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q99KU6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q99KU6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q99KU6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q99KU6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q99KU6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q99KU6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q99KU6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q99KU6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q99KU6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q99KU6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q99KU6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q99KU6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q99KU6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q99KU6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q99KU6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q99KU6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q99KU6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q99KU6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q99KU6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q99KU6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q99KU6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q99KU6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q99KU6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q99KU6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q99KU6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q99KU6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q99KU6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q99KU6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q99KU6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q99KU6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q99KU6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q99KU6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q99KU6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q99KU6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q99KU6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q99KU6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q99KU6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q99KU6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q99KU6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q99KU6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q99KU6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99KU6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99KU6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99KU6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99KU6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99KU6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99KU6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99KU6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99KU6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99KU6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99KU6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99KU6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99KU6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99KU6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99KU6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99KU6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99KU6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99KU6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99KU6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99KU6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99KU6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99KU6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99KU6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99KU6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99KU6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99KU6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99KU6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99KU6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99KU6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99KU6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99KU6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99KU6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99KU6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99KU6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99KU6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99KU6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99KU6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99KU6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99KU6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99KU6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99KU6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99KU6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99KU6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99KU6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99KU6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99KU6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99KU6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99KU6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99KU6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99KU6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99KU6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99KU6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99KU6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms