Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmp1Q99KU0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms