Protein–RNA interactions for Protein: Q99KS2

Ngrn, Neugrin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgrnQ99KS2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NgrnQ99KS2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NgrnQ99KS2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NgrnQ99KS2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NgrnQ99KS2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms