Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf19Q99KP6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms