Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pls3Q99K51 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms