Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlgn1Q99K10 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlgn1Q99K10 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms