Protein–RNA interactions for Protein: Q99J25

Mrm1, rRNA methyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrm1Q99J25 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrm1Q99J25 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrm1Q99J25 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms