Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Rnf144aQ925F3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Rnf144aQ925F3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Rnf144aQ925F3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnf144aQ925F3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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Rnf144aQ925F3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Rnf144aQ925F3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Rnf144aQ925F3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Rnf144aQ925F3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Rnf144aQ925F3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf144aQ925F3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Rnf144aQ925F3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf144aQ925F3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Rnf144aQ925F3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Rnf144aQ925F3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf144aQ925F3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf144aQ925F3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf144aQ925F3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf144aQ925F3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Rnf144aQ925F3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Rnf144aQ925F3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf144aQ925F3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Rnf144aQ925F3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf144aQ925F3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf144aQ925F3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf144aQ925F3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf144aQ925F3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf144aQ925F3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf144aQ925F3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf144aQ925F3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf144aQ925F3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf144aQ925F3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf144aQ925F3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf144aQ925F3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf144aQ925F3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf144aQ925F3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf144aQ925F3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf144aQ925F3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf144aQ925F3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf144aQ925F3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf144aQ925F3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf144aQ925F3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf144aQ925F3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf144aQ925F3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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