Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms