Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clip1Q922J3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms