Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TardbpQ921F2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms