Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Odf3Q920N1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Odf3Q920N1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Odf3Q920N1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Odf3Q920N1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Odf3Q920N1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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