Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms