Protein–RNA interactions for Protein: Q91WT4

Dnajc17, DnaJ homolog subfamily C member 17, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc17Q91WT4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnajc17Q91WT4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms