Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd3Q91WC0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms