Protein–RNA interactions for Protein: Q91W92

Cdc42ep1, Cdc42 effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep1Q91W92 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep1Q91W92 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep1Q91W92 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep1Q91W92 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep1Q91W92 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep1Q91W92 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep1Q91W92 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep1Q91W92 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep1Q91W92 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep1Q91W92 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep1Q91W92 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep1Q91W92 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep1Q91W92 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms