Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms