Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU6

Dcaf11, DDB1- and CUL4-associated factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf11Q91VU6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dcaf11Q91VU6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dcaf11Q91VU6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms