Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nsmce2Q91VT1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms