Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms