Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Odf4Q8VI88 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms