Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp4Q8VHC5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms