Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM1

Rnf130, E3 ubiquitin-protein ligase RNF130, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf130Q8VEM1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf130Q8VEM1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms