Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ccdc115Q8VE99 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc115Q8VE99 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms