Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cul7Q8VE73 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cul7Q8VE73 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul7Q8VE73 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul7Q8VE73 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul7Q8VE73 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul7Q8VE73 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul7Q8VE73 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul7Q8VE73 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul7Q8VE73 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul7Q8VE73 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul7Q8VE73 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul7Q8VE73 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul7Q8VE73 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul7Q8VE73 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul7Q8VE73 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul7Q8VE73 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul7Q8VE73 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul7Q8VE73 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul7Q8VE73 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul7Q8VE73 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul7Q8VE73 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul7Q8VE73 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul7Q8VE73 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul7Q8VE73 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul7Q8VE73 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cul7Q8VE73 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul7Q8VE73 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms