Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE28

Nkd2, Protein naked cuticle homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd2Q8VE28 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms