Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rprd1aQ8VDS4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms