Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rdh10Q8VCH7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rdh10Q8VCH7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rdh10Q8VCH7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rdh10Q8VCH7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rdh10Q8VCH7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rdh10Q8VCH7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rdh10Q8VCH7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rdh10Q8VCH7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rdh10Q8VCH7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rdh10Q8VCH7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rdh10Q8VCH7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Rdh10Q8VCH7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Rdh10Q8VCH7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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