Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops8Q8VBV7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops8Q8VBV7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms