Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4F0

Mcoln3, Mucolipin-3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln3Q8R4F0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mcoln3Q8R4F0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms