Protein–RNA interactions for Protein: Q8R317

Ubqln1, Ubiquilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln1Q8R317 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubqln1Q8R317 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubqln1Q8R317 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms