Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2C9

Vmn1r28, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r28Q8R2C9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Vmn1r28Q8R2C9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r28Q8R2C9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r28Q8R2C9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r28Q8R2C9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r28Q8R2C9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Vmn1r28Q8R2C9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r28Q8R2C9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r28Q8R2C9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r28Q8R2C9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Vmn1r28Q8R2C9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r28Q8R2C9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Vmn1r28Q8R2C9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Vmn1r28Q8R2C9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r28Q8R2C9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Vmn1r28Q8R2C9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r28Q8R2C9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Vmn1r28Q8R2C9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r28Q8R2C9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r28Q8R2C9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r28Q8R2C9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r28Q8R2C9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r28Q8R2C9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r28Q8R2C9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Vmn1r28Q8R2C9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Vmn1r28Q8R2C9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Vmn1r28Q8R2C9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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