Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atg10Q8R1P4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms