Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b4Q8QZY9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms