Protein–RNA interactions for Protein: Q8K445

Clrn1, Clarin-1, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn1Q8K445 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Clrn1Q8K445 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Clrn1Q8K445 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Clrn1Q8K445 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn1Q8K445 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn1Q8K445 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn1Q8K445 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn1Q8K445 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn1Q8K445 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn1Q8K445 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms