Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lin28aQ8K3Y3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms