Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MyripQ8K3I4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MyripQ8K3I4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms