Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3A0

Hscb, Iron-sulfur cluster co-chaperone protein HscB, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HscbQ8K3A0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HscbQ8K3A0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HscbQ8K3A0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HscbQ8K3A0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HscbQ8K3A0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HscbQ8K3A0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HscbQ8K3A0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HscbQ8K3A0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HscbQ8K3A0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HscbQ8K3A0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HscbQ8K3A0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HscbQ8K3A0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HscbQ8K3A0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HscbQ8K3A0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms